Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms