Protein–RNA interactions for Protein: O88834

Shd, SH2 domain-containing adapter protein D, mousemouse

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ShdO88834 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ShdO88834 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ShdO88834 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ShdO88834 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ShdO88834 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ShdO88834 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ShdO88834 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ShdO88834 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ShdO88834 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ShdO88834 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ShdO88834 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ShdO88834 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ShdO88834 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ShdO88834 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ShdO88834 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ShdO88834 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ShdO88834 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ShdO88834 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ShdO88834 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ShdO88834 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ShdO88834 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ShdO88834 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ShdO88834 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ShdO88834 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ShdO88834 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ShdO88834 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ShdO88834 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ShdO88834 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ShdO88834 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ShdO88834 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ShdO88834 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ShdO88834 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ShdO88834 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ShdO88834 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ShdO88834 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ShdO88834 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ShdO88834 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ShdO88834 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ShdO88834 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ShdO88834 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ShdO88834 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ShdO88834 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ShdO88834 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ShdO88834 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ShdO88834 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
ShdO88834 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
ShdO88834 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
ShdO88834 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
ShdO88834 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
ShdO88834 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ShdO88834 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ShdO88834 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ShdO88834 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ShdO88834 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ShdO88834 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ShdO88834 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ShdO88834 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ShdO88834 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ShdO88834 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ShdO88834 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ShdO88834 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ShdO88834 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ShdO88834 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ShdO88834 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ShdO88834 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ShdO88834 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ShdO88834 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ShdO88834 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ShdO88834 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ShdO88834 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ShdO88834 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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ShdO88834 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
ShdO88834 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ShdO88834 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ShdO88834 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
ShdO88834 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ShdO88834 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ShdO88834 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ShdO88834 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ShdO88834 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ShdO88834 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ShdO88834 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ShdO88834 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ShdO88834 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ShdO88834 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ShdO88834 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ShdO88834 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ShdO88834 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ShdO88834 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ShdO88834 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ShdO88834 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ShdO88834 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ShdO88834 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ShdO88834 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ShdO88834 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ShdO88834 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ShdO88834 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ShdO88834 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ShdO88834 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
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