Protein–RNA interactions for Protein: O88508

Dnmt3a, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3aO88508 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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