Protein–RNA interactions for Protein: O88456

Capns1, Calpain small subunit 1, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns1O88456 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Capns1O88456 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Capns1O88456 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Capns1O88456 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Capns1O88456 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Capns1O88456 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Capns1O88456 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Capns1O88456 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Capns1O88456 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Capns1O88456 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Capns1O88456 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Capns1O88456 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Capns1O88456 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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