Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cfdp1O88271 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cfdp1O88271 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cfdp1O88271 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cfdp1O88271 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cfdp1O88271 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cfdp1O88271 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cfdp1O88271 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cfdp1O88271 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cfdp1O88271 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cfdp1O88271 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cfdp1O88271 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cfdp1O88271 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cfdp1O88271 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cfdp1O88271 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cfdp1O88271 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cfdp1O88271 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cfdp1O88271 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cfdp1O88271 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cfdp1O88271 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cfdp1O88271 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cfdp1O88271 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cfdp1O88271 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cfdp1O88271 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cfdp1O88271 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cfdp1O88271 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cfdp1O88271 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cfdp1O88271 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cfdp1O88271 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cfdp1O88271 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cfdp1O88271 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cfdp1O88271 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cfdp1O88271 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cfdp1O88271 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cfdp1O88271 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cfdp1O88271 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cfdp1O88271 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cfdp1O88271 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cfdp1O88271 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cfdp1O88271 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cfdp1O88271 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cfdp1O88271 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cfdp1O88271 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cfdp1O88271 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cfdp1O88271 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cfdp1O88271 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cfdp1O88271 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cfdp1O88271 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cfdp1O88271 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cfdp1O88271 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cfdp1O88271 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cfdp1O88271 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cfdp1O88271 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cfdp1O88271 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cfdp1O88271 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cfdp1O88271 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cfdp1O88271 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cfdp1O88271 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cfdp1O88271 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cfdp1O88271 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cfdp1O88271 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cfdp1O88271 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cfdp1O88271 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cfdp1O88271 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cfdp1O88271 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cfdp1O88271 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cfdp1O88271 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cfdp1O88271 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cfdp1O88271 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cfdp1O88271 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cfdp1O88271 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cfdp1O88271 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Cfdp1O88271 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Cfdp1O88271 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cfdp1O88271 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cfdp1O88271 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cfdp1O88271 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cfdp1O88271 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cfdp1O88271 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cfdp1O88271 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cfdp1O88271 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cfdp1O88271 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cfdp1O88271 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cfdp1O88271 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cfdp1O88271 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cfdp1O88271 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cfdp1O88271 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cfdp1O88271 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cfdp1O88271 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cfdp1O88271 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cfdp1O88271 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cfdp1O88271 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cfdp1O88271 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cfdp1O88271 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cfdp1O88271 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cfdp1O88271 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cfdp1O88271 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cfdp1O88271 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cfdp1O88271 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cfdp1O88271 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
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