Protein–RNA interactions for Protein: O70373

Xirp1, Xin actin-binding repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xirp1O70373 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms