Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lnx1O70263 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lnx1O70263 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lnx1O70263 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lnx1O70263 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Lnx1O70263 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lnx1O70263 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Lnx1O70263 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lnx1O70263 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lnx1O70263 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lnx1O70263 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Lnx1O70263 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lnx1O70263 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lnx1O70263 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lnx1O70263 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lnx1O70263 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lnx1O70263 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lnx1O70263 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lnx1O70263 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lnx1O70263 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lnx1O70263 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Lnx1O70263 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lnx1O70263 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lnx1O70263 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lnx1O70263 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lnx1O70263 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lnx1O70263 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lnx1O70263 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lnx1O70263 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lnx1O70263 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Lnx1O70263 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lnx1O70263 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lnx1O70263 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Lnx1O70263 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Lnx1O70263 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Lnx1O70263 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Lnx1O70263 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lnx1O70263 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lnx1O70263 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Lnx1O70263 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Lnx1O70263 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Lnx1O70263 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lnx1O70263 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lnx1O70263 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lnx1O70263 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lnx1O70263 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lnx1O70263 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lnx1O70263 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lnx1O70263 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lnx1O70263 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lnx1O70263 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lnx1O70263 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lnx1O70263 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lnx1O70263 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lnx1O70263 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lnx1O70263 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lnx1O70263 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lnx1O70263 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lnx1O70263 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lnx1O70263 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lnx1O70263 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lnx1O70263 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lnx1O70263 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lnx1O70263 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lnx1O70263 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lnx1O70263 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Lnx1O70263 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lnx1O70263 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lnx1O70263 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lnx1O70263 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lnx1O70263 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lnx1O70263 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lnx1O70263 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lnx1O70263 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lnx1O70263 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lnx1O70263 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lnx1O70263 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lnx1O70263 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lnx1O70263 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lnx1O70263 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lnx1O70263 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lnx1O70263 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lnx1O70263 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lnx1O70263 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lnx1O70263 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lnx1O70263 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lnx1O70263 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Lnx1O70263 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lnx1O70263 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Lnx1O70263 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lnx1O70263 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lnx1O70263 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lnx1O70263 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lnx1O70263 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lnx1O70263 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lnx1O70263 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lnx1O70263 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lnx1O70263 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lnx1O70263 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lnx1O70263 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms