Protein–RNA interactions for Protein: O70157

Top3a, DNA topoisomerase 3-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3aO70157 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Top3aO70157 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Top3aO70157 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Top3aO70157 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Top3aO70157 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Top3aO70157 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Top3aO70157 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Top3aO70157 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Top3aO70157 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Top3aO70157 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Top3aO70157 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Top3aO70157 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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