Protein–RNA interactions for Protein: O55111

Dsg2, Desmoglein-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg2O55111 Tfpi2-201ENSMUST00000031674 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 C130071C03Rik-203ENSMUST00000182788 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
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Dsg2O55111 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Dsg2O55111 AC106830.1-201ENSMUST00000228032 1003 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 Gm13615-201ENSMUST00000120242 1612 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Dsg2O55111 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Dsg2O55111 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Dsg2O55111 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Dsg2O55111 Gm15063-201ENSMUST00000152648 895 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Dsg2O55111 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Dsg2O55111 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Dsg2O55111 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Dsg2O55111 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Dsg2O55111 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Dsg2O55111 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 Gm20825-201ENSMUST00000178149 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
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Dsg2O55111 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Dsg2O55111 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
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