Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SlkO54988 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SlkO54988 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SlkO54988 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SlkO54988 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SlkO54988 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SlkO54988 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SlkO54988 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SlkO54988 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SlkO54988 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SlkO54988 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
SlkO54988 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SlkO54988 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SlkO54988 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SlkO54988 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SlkO54988 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SlkO54988 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SlkO54988 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SlkO54988 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SlkO54988 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SlkO54988 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SlkO54988 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SlkO54988 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SlkO54988 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SlkO54988 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SlkO54988 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SlkO54988 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SlkO54988 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SlkO54988 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SlkO54988 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SlkO54988 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SlkO54988 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SlkO54988 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SlkO54988 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SlkO54988 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SlkO54988 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SlkO54988 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SlkO54988 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SlkO54988 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SlkO54988 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SlkO54988 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SlkO54988 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SlkO54988 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SlkO54988 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SlkO54988 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SlkO54988 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SlkO54988 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SlkO54988 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SlkO54988 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SlkO54988 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SlkO54988 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SlkO54988 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SlkO54988 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SlkO54988 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SlkO54988 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SlkO54988 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SlkO54988 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SlkO54988 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SlkO54988 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SlkO54988 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SlkO54988 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SlkO54988 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SlkO54988 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SlkO54988 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SlkO54988 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SlkO54988 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SlkO54988 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SlkO54988 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SlkO54988 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SlkO54988 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SlkO54988 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SlkO54988 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SlkO54988 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SlkO54988 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SlkO54988 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SlkO54988 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SlkO54988 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SlkO54988 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SlkO54988 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SlkO54988 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SlkO54988 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SlkO54988 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SlkO54988 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SlkO54988 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SlkO54988 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SlkO54988 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SlkO54988 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SlkO54988 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SlkO54988 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SlkO54988 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SlkO54988 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SlkO54988 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SlkO54988 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SlkO54988 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SlkO54988 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SlkO54988 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SlkO54988 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SlkO54988 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SlkO54988 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SlkO54988 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms