Protein–RNA interactions for Protein: O35988

Sdc4, Syndecan-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc4O35988 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sdc4O35988 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sdc4O35988 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sdc4O35988 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sdc4O35988 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sdc4O35988 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sdc4O35988 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sdc4O35988 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sdc4O35988 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sdc4O35988 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sdc4O35988 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sdc4O35988 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Sdc4O35988 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sdc4O35988 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sdc4O35988 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sdc4O35988 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sdc4O35988 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sdc4O35988 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sdc4O35988 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sdc4O35988 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sdc4O35988 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sdc4O35988 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sdc4O35988 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sdc4O35988 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sdc4O35988 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sdc4O35988 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sdc4O35988 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sdc4O35988 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sdc4O35988 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sdc4O35988 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sdc4O35988 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sdc4O35988 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sdc4O35988 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sdc4O35988 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sdc4O35988 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sdc4O35988 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sdc4O35988 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Sdc4O35988 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sdc4O35988 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sdc4O35988 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sdc4O35988 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sdc4O35988 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sdc4O35988 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sdc4O35988 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sdc4O35988 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sdc4O35988 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sdc4O35988 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Sdc4O35988 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sdc4O35988 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sdc4O35988 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sdc4O35988 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sdc4O35988 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sdc4O35988 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sdc4O35988 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sdc4O35988 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sdc4O35988 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sdc4O35988 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sdc4O35988 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sdc4O35988 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sdc4O35988 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sdc4O35988 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Sdc4O35988 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sdc4O35988 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sdc4O35988 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sdc4O35988 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sdc4O35988 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sdc4O35988 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sdc4O35988 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sdc4O35988 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sdc4O35988 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sdc4O35988 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Sdc4O35988 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Sdc4O35988 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Sdc4O35988 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sdc4O35988 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sdc4O35988 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sdc4O35988 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sdc4O35988 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sdc4O35988 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sdc4O35988 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sdc4O35988 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sdc4O35988 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sdc4O35988 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sdc4O35988 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sdc4O35988 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sdc4O35988 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sdc4O35988 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sdc4O35988 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sdc4O35988 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Sdc4O35988 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sdc4O35988 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sdc4O35988 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sdc4O35988 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sdc4O35988 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sdc4O35988 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sdc4O35988 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sdc4O35988 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sdc4O35988 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sdc4O35988 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sdc4O35988 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms