Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FxnO35943 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FxnO35943 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FxnO35943 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FxnO35943 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FxnO35943 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
FxnO35943 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FxnO35943 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FxnO35943 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FxnO35943 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FxnO35943 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FxnO35943 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FxnO35943 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FxnO35943 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FxnO35943 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FxnO35943 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FxnO35943 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FxnO35943 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FxnO35943 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
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FxnO35943 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
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FxnO35943 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FxnO35943 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FxnO35943 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FxnO35943 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FxnO35943 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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FxnO35943 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FxnO35943 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FxnO35943 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FxnO35943 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FxnO35943 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FxnO35943 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FxnO35943 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FxnO35943 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FxnO35943 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FxnO35943 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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FxnO35943 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FxnO35943 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FxnO35943 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FxnO35943 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FxnO35943 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FxnO35943 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FxnO35943 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FxnO35943 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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FxnO35943 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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FxnO35943 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FxnO35943 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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FxnO35943 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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FxnO35943 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FxnO35943 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FxnO35943 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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FxnO35943 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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FxnO35943 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FxnO35943 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
FxnO35943 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FxnO35943 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FxnO35943 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FxnO35943 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FxnO35943 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FxnO35943 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FxnO35943 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
FxnO35943 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FxnO35943 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FxnO35943 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FxnO35943 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FxnO35943 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FxnO35943 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FxnO35943 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FxnO35943 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FxnO35943 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms