Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sp100O35892 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sp100O35892 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sp100O35892 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sp100O35892 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sp100O35892 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sp100O35892 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sp100O35892 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sp100O35892 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sp100O35892 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sp100O35892 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sp100O35892 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sp100O35892 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sp100O35892 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sp100O35892 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sp100O35892 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Sp100O35892 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sp100O35892 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sp100O35892 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Sp100O35892 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Sp100O35892 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sp100O35892 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Sp100O35892 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sp100O35892 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sp100O35892 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sp100O35892 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Sp100O35892 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sp100O35892 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sp100O35892 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sp100O35892 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sp100O35892 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sp100O35892 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sp100O35892 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sp100O35892 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sp100O35892 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sp100O35892 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Sp100O35892 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Sp100O35892 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Sp100O35892 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Sp100O35892 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sp100O35892 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sp100O35892 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sp100O35892 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sp100O35892 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sp100O35892 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sp100O35892 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sp100O35892 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sp100O35892 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sp100O35892 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sp100O35892 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sp100O35892 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sp100O35892 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sp100O35892 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sp100O35892 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sp100O35892 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Sp100O35892 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sp100O35892 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sp100O35892 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sp100O35892 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sp100O35892 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sp100O35892 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sp100O35892 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Sp100O35892 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sp100O35892 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sp100O35892 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
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Sp100O35892 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sp100O35892 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sp100O35892 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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Sp100O35892 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sp100O35892 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sp100O35892 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sp100O35892 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sp100O35892 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sp100O35892 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sp100O35892 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sp100O35892 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sp100O35892 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Sp100O35892 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sp100O35892 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sp100O35892 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sp100O35892 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Sp100O35892 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Sp100O35892 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sp100O35892 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sp100O35892 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Sp100O35892 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sp100O35892 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sp100O35892 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Sp100O35892 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sp100O35892 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sp100O35892 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sp100O35892 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sp100O35892 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sp100O35892 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sp100O35892 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sp100O35892 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sp100O35892 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sp100O35892 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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