Protein–RNA interactions for Protein: O35491

Clk2, Dual specificity protein kinase CLK2, mousemouse

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk2O35491 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clk2O35491 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clk2O35491 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Clk2O35491 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clk2O35491 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clk2O35491 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Clk2O35491 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clk2O35491 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Clk2O35491 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clk2O35491 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clk2O35491 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clk2O35491 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clk2O35491 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clk2O35491 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clk2O35491 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clk2O35491 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clk2O35491 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clk2O35491 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clk2O35491 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clk2O35491 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clk2O35491 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clk2O35491 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clk2O35491 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clk2O35491 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clk2O35491 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clk2O35491 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clk2O35491 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clk2O35491 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clk2O35491 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clk2O35491 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clk2O35491 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clk2O35491 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clk2O35491 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clk2O35491 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clk2O35491 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clk2O35491 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clk2O35491 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clk2O35491 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clk2O35491 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clk2O35491 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clk2O35491 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clk2O35491 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clk2O35491 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clk2O35491 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clk2O35491 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clk2O35491 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clk2O35491 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clk2O35491 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clk2O35491 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clk2O35491 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clk2O35491 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clk2O35491 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clk2O35491 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clk2O35491 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clk2O35491 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clk2O35491 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clk2O35491 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clk2O35491 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clk2O35491 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clk2O35491 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clk2O35491 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clk2O35491 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clk2O35491 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Clk2O35491 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clk2O35491 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Clk2O35491 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clk2O35491 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clk2O35491 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clk2O35491 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clk2O35491 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clk2O35491 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clk2O35491 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clk2O35491 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clk2O35491 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clk2O35491 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clk2O35491 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clk2O35491 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Clk2O35491 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clk2O35491 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clk2O35491 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clk2O35491 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clk2O35491 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clk2O35491 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clk2O35491 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clk2O35491 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clk2O35491 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clk2O35491 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clk2O35491 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clk2O35491 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clk2O35491 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clk2O35491 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clk2O35491 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clk2O35491 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clk2O35491 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clk2O35491 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clk2O35491 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clk2O35491 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clk2O35491 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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