Protein–RNA interactions for Protein: O35445

Rnf5, E3 ubiquitin-protein ligase RNF5, mousemouse

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Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf5O35445 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Rnf5O35445 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Rnf5O35445 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Rnf5O35445 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Rnf5O35445 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Rnf5O35445 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Rnf5O35445 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Rnf5O35445 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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