Protein–RNA interactions for Protein: O35231

Kifc3, Kinesin-like protein KIFC3, mousemouse

Predictions only

Length 824 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kifc3O35231 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Kifc3O35231 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kifc3O35231 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kifc3O35231 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kifc3O35231 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kifc3O35231 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kifc3O35231 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kifc3O35231 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kifc3O35231 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kifc3O35231 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kifc3O35231 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kifc3O35231 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kifc3O35231 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kifc3O35231 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kifc3O35231 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kifc3O35231 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kifc3O35231 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kifc3O35231 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kifc3O35231 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kifc3O35231 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kifc3O35231 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kifc3O35231 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Kifc3O35231 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kifc3O35231 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kifc3O35231 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kifc3O35231 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kifc3O35231 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kifc3O35231 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kifc3O35231 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kifc3O35231 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kifc3O35231 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Kifc3O35231 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kifc3O35231 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kifc3O35231 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kifc3O35231 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kifc3O35231 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kifc3O35231 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kifc3O35231 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kifc3O35231 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kifc3O35231 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kifc3O35231 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kifc3O35231 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Kifc3O35231 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kifc3O35231 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kifc3O35231 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kifc3O35231 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kifc3O35231 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kifc3O35231 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kifc3O35231 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kifc3O35231 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kifc3O35231 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kifc3O35231 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kifc3O35231 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kifc3O35231 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kifc3O35231 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kifc3O35231 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kifc3O35231 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kifc3O35231 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kifc3O35231 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Kifc3O35231 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kifc3O35231 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kifc3O35231 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Kifc3O35231 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kifc3O35231 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kifc3O35231 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Kifc3O35231 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kifc3O35231 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kifc3O35231 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kifc3O35231 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kifc3O35231 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kifc3O35231 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kifc3O35231 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kifc3O35231 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kifc3O35231 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kifc3O35231 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kifc3O35231 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kifc3O35231 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kifc3O35231 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kifc3O35231 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Kifc3O35231 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Kifc3O35231 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kifc3O35231 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kifc3O35231 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Kifc3O35231 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kifc3O35231 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kifc3O35231 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kifc3O35231 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kifc3O35231 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kifc3O35231 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kifc3O35231 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kifc3O35231 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kifc3O35231 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kifc3O35231 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms