Protein–RNA interactions for Protein: O35137

Alx4, Homeobox protein aristaless-like 4, mousemouse

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Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alx4O35137 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Alx4O35137 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Alx4O35137 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Alx4O35137 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Alx4O35137 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Alx4O35137 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Alx4O35137 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Alx4O35137 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Alx4O35137 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Alx4O35137 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Alx4O35137 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Alx4O35137 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Alx4O35137 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Alx4O35137 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Alx4O35137 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Alx4O35137 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Alx4O35137 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Alx4O35137 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Alx4O35137 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Alx4O35137 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Alx4O35137 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Alx4O35137 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Alx4O35137 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Alx4O35137 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Alx4O35137 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Alx4O35137 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Alx4O35137 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Alx4O35137 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Alx4O35137 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Alx4O35137 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Alx4O35137 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Alx4O35137 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Alx4O35137 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Alx4O35137 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Alx4O35137 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Alx4O35137 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Alx4O35137 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Alx4O35137 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Alx4O35137 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Alx4O35137 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Alx4O35137 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Alx4O35137 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Alx4O35137 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Alx4O35137 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Alx4O35137 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Alx4O35137 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Alx4O35137 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Alx4O35137 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Alx4O35137 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Alx4O35137 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Alx4O35137 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Alx4O35137 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Alx4O35137 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Alx4O35137 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Alx4O35137 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Alx4O35137 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Alx4O35137 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Alx4O35137 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Alx4O35137 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Alx4O35137 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Alx4O35137 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Alx4O35137 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Alx4O35137 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Alx4O35137 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Alx4O35137 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Alx4O35137 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Alx4O35137 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Alx4O35137 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Alx4O35137 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Alx4O35137 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Alx4O35137 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Alx4O35137 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Alx4O35137 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Alx4O35137 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Alx4O35137 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Alx4O35137 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Alx4O35137 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Alx4O35137 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Alx4O35137 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Alx4O35137 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Alx4O35137 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Alx4O35137 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Alx4O35137 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Alx4O35137 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Alx4O35137 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Alx4O35137 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Alx4O35137 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Alx4O35137 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Alx4O35137 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Alx4O35137 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Alx4O35137 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Alx4O35137 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Alx4O35137 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Alx4O35137 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Alx4O35137 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Alx4O35137 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Alx4O35137 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Alx4O35137 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Alx4O35137 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Alx4O35137 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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