Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

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Length 405 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Casq1O09165 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Casq1O09165 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Casq1O09165 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Casq1O09165 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Casq1O09165 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Casq1O09165 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Casq1O09165 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Casq1O09165 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Casq1O09165 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Casq1O09165 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Casq1O09165 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Casq1O09165 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Casq1O09165 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Casq1O09165 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Casq1O09165 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Casq1O09165 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Casq1O09165 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Casq1O09165 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Casq1O09165 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Casq1O09165 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Casq1O09165 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Casq1O09165 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Casq1O09165 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Casq1O09165 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Casq1O09165 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Casq1O09165 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Casq1O09165 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Casq1O09165 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Casq1O09165 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Casq1O09165 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Casq1O09165 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Casq1O09165 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Casq1O09165 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Casq1O09165 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Casq1O09165 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Casq1O09165 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Casq1O09165 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Casq1O09165 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Casq1O09165 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Casq1O09165 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Casq1O09165 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Casq1O09165 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Casq1O09165 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Casq1O09165 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Casq1O09165 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Casq1O09165 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Casq1O09165 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Casq1O09165 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Casq1O09165 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Casq1O09165 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Casq1O09165 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Casq1O09165 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Casq1O09165 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Casq1O09165 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Casq1O09165 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Casq1O09165 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Casq1O09165 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Casq1O09165 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Casq1O09165 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Casq1O09165 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Casq1O09165 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Casq1O09165 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Casq1O09165 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Casq1O09165 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Casq1O09165 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Casq1O09165 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Casq1O09165 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Casq1O09165 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Casq1O09165 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Casq1O09165 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Casq1O09165 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Casq1O09165 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Casq1O09165 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Casq1O09165 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Casq1O09165 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Casq1O09165 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Casq1O09165 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Casq1O09165 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Casq1O09165 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Casq1O09165 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Casq1O09165 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Casq1O09165 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Casq1O09165 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Casq1O09165 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Casq1O09165 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Casq1O09165 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Casq1O09165 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Casq1O09165 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Casq1O09165 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Casq1O09165 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Casq1O09165 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Casq1O09165 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Casq1O09165 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Casq1O09165 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Casq1O09165 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Casq1O09165 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Casq1O09165 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Casq1O09165 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Casq1O09165 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
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