Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MttpO08601 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MttpO08601 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
MttpO08601 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MttpO08601 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MttpO08601 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MttpO08601 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MttpO08601 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MttpO08601 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
MttpO08601 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MttpO08601 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MttpO08601 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
MttpO08601 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MttpO08601 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.05■□□□□ -0
MttpO08601 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MttpO08601 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MttpO08601 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MttpO08601 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MttpO08601 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MttpO08601 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MttpO08601 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MttpO08601 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MttpO08601 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
MttpO08601 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MttpO08601 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MttpO08601 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MttpO08601 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.04■□□□□ -0
MttpO08601 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.04■□□□□ -0
MttpO08601 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.04■□□□□ -0
MttpO08601 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MttpO08601 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.04■□□□□ -0
MttpO08601 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.04■□□□□ -0
MttpO08601 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MttpO08601 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MttpO08601 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MttpO08601 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MttpO08601 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MttpO08601 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MttpO08601 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MttpO08601 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MttpO08601 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MttpO08601 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MttpO08601 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.03■□□□□ -0
MttpO08601 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MttpO08601 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MttpO08601 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MttpO08601 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MttpO08601 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MttpO08601 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MttpO08601 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MttpO08601 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MttpO08601 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MttpO08601 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MttpO08601 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MttpO08601 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
MttpO08601 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MttpO08601 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.03■□□□□ -0
MttpO08601 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MttpO08601 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MttpO08601 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.03■□□□□ -0
MttpO08601 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.03■□□□□ -0
MttpO08601 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
MttpO08601 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MttpO08601 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MttpO08601 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MttpO08601 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MttpO08601 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.03■□□□□ -0
MttpO08601 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MttpO08601 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MttpO08601 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MttpO08601 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MttpO08601 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MttpO08601 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MttpO08601 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MttpO08601 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MttpO08601 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MttpO08601 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MttpO08601 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MttpO08601 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
MttpO08601 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
MttpO08601 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MttpO08601 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MttpO08601 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MttpO08601 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MttpO08601 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MttpO08601 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MttpO08601 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MttpO08601 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MttpO08601 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
MttpO08601 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
MttpO08601 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MttpO08601 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
MttpO08601 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
MttpO08601 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
MttpO08601 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.02■□□□□ -0
MttpO08601 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.02■□□□□ -0
MttpO08601 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MttpO08601 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MttpO08601 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
MttpO08601 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms