Protein–RNA interactions for Protein: L7N248

Gm6871, Predicted gene 6871, mousemouse

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Length 545 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6871L7N248 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm6871L7N248 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm6871L7N248 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm6871L7N248 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm6871L7N248 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm6871L7N248 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm6871L7N248 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm6871L7N248 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm6871L7N248 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm6871L7N248 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm6871L7N248 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm6871L7N248 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm6871L7N248 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm6871L7N248 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm6871L7N248 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm6871L7N248 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm6871L7N248 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm6871L7N248 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm6871L7N248 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm6871L7N248 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm6871L7N248 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm6871L7N248 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm6871L7N248 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm6871L7N248 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm6871L7N248 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm6871L7N248 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm6871L7N248 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm6871L7N248 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm6871L7N248 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm6871L7N248 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm6871L7N248 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm6871L7N248 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm6871L7N248 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm6871L7N248 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gm6871L7N248 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gm6871L7N248 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gm6871L7N248 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gm6871L7N248 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gm6871L7N248 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gm6871L7N248 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gm6871L7N248 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gm6871L7N248 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gm6871L7N248 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm6871L7N248 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm6871L7N248 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm6871L7N248 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm6871L7N248 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm6871L7N248 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm6871L7N248 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm6871L7N248 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm6871L7N248 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm6871L7N248 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm6871L7N248 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm6871L7N248 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm6871L7N248 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm6871L7N248 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm6871L7N248 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm6871L7N248 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm6871L7N248 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm6871L7N248 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm6871L7N248 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm6871L7N248 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm6871L7N248 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm6871L7N248 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm6871L7N248 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm6871L7N248 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm6871L7N248 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm6871L7N248 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm6871L7N248 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm6871L7N248 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm6871L7N248 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm6871L7N248 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm6871L7N248 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm6871L7N248 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm6871L7N248 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm6871L7N248 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm6871L7N248 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm6871L7N248 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm6871L7N248 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm6871L7N248 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm6871L7N248 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm6871L7N248 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm6871L7N248 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm6871L7N248 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm6871L7N248 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm6871L7N248 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm6871L7N248 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm6871L7N248 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm6871L7N248 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm6871L7N248 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm6871L7N248 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm6871L7N248 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm6871L7N248 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm6871L7N248 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm6871L7N248 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm6871L7N248 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm6871L7N248 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm6871L7N248 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm6871L7N248 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm6871L7N248 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
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