Protein–RNA interactions for Protein: J3QP53

Gm5294, Predicted gene 5294, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5294J3QP53 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms