Protein–RNA interactions for Protein: J3QNY8

Gm19965, Predicted gene, 19965, mousemouse

Predictions only

Length 723 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm19965J3QNY8 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm19965J3QNY8 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm19965J3QNY8 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm19965J3QNY8 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Gm19965J3QNY8 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm19965J3QNY8 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Gm19965J3QNY8 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm19965J3QNY8 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm19965J3QNY8 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm19965J3QNY8 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm19965J3QNY8 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Gm19965J3QNY8 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Gm19965J3QNY8 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm19965J3QNY8 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm19965J3QNY8 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm19965J3QNY8 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm19965J3QNY8 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm19965J3QNY8 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm19965J3QNY8 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Gm19965J3QNY8 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm19965J3QNY8 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Gm19965J3QNY8 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm19965J3QNY8 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Gm19965J3QNY8 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm19965J3QNY8 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm19965J3QNY8 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Gm19965J3QNY8 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm19965J3QNY8 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
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Gm19965J3QNY8 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
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Gm19965J3QNY8 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gm19965J3QNY8 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm19965J3QNY8 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm19965J3QNY8 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Gm19965J3QNY8 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Gm19965J3QNY8 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm19965J3QNY8 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm19965J3QNY8 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Gm19965J3QNY8 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm19965J3QNY8 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Gm19965J3QNY8 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm19965J3QNY8 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm19965J3QNY8 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm19965J3QNY8 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm19965J3QNY8 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm19965J3QNY8 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm19965J3QNY8 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm19965J3QNY8 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm19965J3QNY8 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm19965J3QNY8 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm19965J3QNY8 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm19965J3QNY8 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm19965J3QNY8 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm19965J3QNY8 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm19965J3QNY8 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm19965J3QNY8 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm19965J3QNY8 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm19965J3QNY8 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm19965J3QNY8 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm19965J3QNY8 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm19965J3QNY8 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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