Protein–RNA interactions for Protein: J3QNV7

Gm10428, Predicted gene 10428, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10428J3QNV7 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms