Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Smim18J3QNP2 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
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