Protein–RNA interactions for Protein: J3QNN2

Gm21976, Predicted gene 21976, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21976J3QNN2 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21976J3QNN2 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21976J3QNN2 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21976J3QNN2 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21976J3QNN2 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21976J3QNN2 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21976J3QNN2 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Gm21976J3QNN2 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21976J3QNN2 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21976J3QNN2 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21976J3QNN2 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21976J3QNN2 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21976J3QNN2 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21976J3QNN2 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21976J3QNN2 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21976J3QNN2 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21976J3QNN2 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21976J3QNN2 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21976J3QNN2 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21976J3QNN2 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21976J3QNN2 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21976J3QNN2 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Gm21976J3QNN2 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21976J3QNN2 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21976J3QNN2 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21976J3QNN2 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21976J3QNN2 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21976J3QNN2 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21976J3QNN2 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21976J3QNN2 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21976J3QNN2 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21976J3QNN2 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21976J3QNN2 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21976J3QNN2 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21976J3QNN2 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Gm21976J3QNN2 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21976J3QNN2 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21976J3QNN2 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Gm21976J3QNN2 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21976J3QNN2 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21976J3QNN2 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21976J3QNN2 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21976J3QNN2 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Gm21976J3QNN2 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21976J3QNN2 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21976J3QNN2 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Gm21976J3QNN2 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Gm21976J3QNN2 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm21976J3QNN2 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm21976J3QNN2 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm21976J3QNN2 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Gm21976J3QNN2 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Gm21976J3QNN2 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm21976J3QNN2 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm21976J3QNN2 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm21976J3QNN2 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm21976J3QNN2 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm21976J3QNN2 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm21976J3QNN2 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm21976J3QNN2 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm21976J3QNN2 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm21976J3QNN2 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm21976J3QNN2 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm21976J3QNN2 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Gm21976J3QNN2 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm21976J3QNN2 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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