Protein–RNA interactions for Protein: J3QNG1

Gm6408, Predicted gene 6408, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6408J3QNG1 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms