Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms