Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU2

Farp1, FERM, ARHGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Farp1F8VPU2 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Olfr1212-201ENSMUST00000055895 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Gm25509-201ENSMUST00000116985 106 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Vmn1r34-201ENSMUST00000074381 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms