Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms