Protein–RNA interactions for Protein: F6VRN1

Smgc, Submandibular gland protein C (Fragment), mousemouse

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmgcF6VRN1 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SmgcF6VRN1 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
SmgcF6VRN1 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.65□□□□□ -0.07
SmgcF6VRN1 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SmgcF6VRN1 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SmgcF6VRN1 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SmgcF6VRN1 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SmgcF6VRN1 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SmgcF6VRN1 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SmgcF6VRN1 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SmgcF6VRN1 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SmgcF6VRN1 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SmgcF6VRN1 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SmgcF6VRN1 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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