Protein–RNA interactions for Protein: F2Z472

Svs3a, Seminal vesicle secretory protein 3A, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Svs3aF2Z472 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Svs3aF2Z472 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Svs3aF2Z472 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Svs3aF2Z472 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Svs3aF2Z472 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Svs3aF2Z472 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Svs3aF2Z472 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Svs3aF2Z472 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Svs3aF2Z472 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Svs3aF2Z472 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Svs3aF2Z472 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Svs3aF2Z472 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Svs3aF2Z472 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Svs3aF2Z472 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Svs3aF2Z472 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Svs3aF2Z472 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Svs3aF2Z472 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Svs3aF2Z472 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Svs3aF2Z472 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Svs3aF2Z472 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Svs3aF2Z472 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Svs3aF2Z472 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Svs3aF2Z472 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Svs3aF2Z472 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Svs3aF2Z472 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Svs3aF2Z472 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Svs3aF2Z472 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Svs3aF2Z472 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Svs3aF2Z472 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Svs3aF2Z472 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Svs3aF2Z472 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Svs3aF2Z472 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Svs3aF2Z472 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Svs3aF2Z472 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Svs3aF2Z472 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Svs3aF2Z472 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Svs3aF2Z472 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Svs3aF2Z472 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Svs3aF2Z472 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Svs3aF2Z472 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Svs3aF2Z472 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Svs3aF2Z472 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Svs3aF2Z472 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Svs3aF2Z472 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Svs3aF2Z472 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Svs3aF2Z472 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Svs3aF2Z472 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Svs3aF2Z472 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Svs3aF2Z472 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Svs3aF2Z472 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Svs3aF2Z472 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Svs3aF2Z472 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Svs3aF2Z472 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Svs3aF2Z472 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Svs3aF2Z472 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Svs3aF2Z472 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Svs3aF2Z472 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Svs3aF2Z472 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Svs3aF2Z472 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Svs3aF2Z472 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Svs3aF2Z472 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Svs3aF2Z472 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Svs3aF2Z472 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Svs3aF2Z472 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Svs3aF2Z472 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Svs3aF2Z472 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Svs3aF2Z472 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Svs3aF2Z472 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Svs3aF2Z472 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Svs3aF2Z472 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Svs3aF2Z472 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Svs3aF2Z472 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Svs3aF2Z472 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Svs3aF2Z472 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Svs3aF2Z472 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Svs3aF2Z472 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Svs3aF2Z472 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Svs3aF2Z472 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Svs3aF2Z472 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Svs3aF2Z472 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Svs3aF2Z472 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Svs3aF2Z472 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Svs3aF2Z472 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Svs3aF2Z472 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Svs3aF2Z472 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Svs3aF2Z472 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Svs3aF2Z472 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Svs3aF2Z472 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Svs3aF2Z472 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Svs3aF2Z472 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Svs3aF2Z472 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Svs3aF2Z472 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Svs3aF2Z472 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Svs3aF2Z472 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Svs3aF2Z472 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Svs3aF2Z472 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Svs3aF2Z472 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Svs3aF2Z472 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Svs3aF2Z472 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Svs3aF2Z472 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms