Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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ApobE9Q414 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
ApobE9Q414 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
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ApobE9Q414 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
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ApobE9Q414 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
ApobE9Q414 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
ApobE9Q414 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
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ApobE9Q414 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
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ApobE9Q414 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
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ApobE9Q414 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
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ApobE9Q414 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
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ApobE9Q414 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
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ApobE9Q414 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
ApobE9Q414 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
ApobE9Q414 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
ApobE9Q414 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
ApobE9Q414 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC8.74□□□□□ -1.01
ApobE9Q414 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
ApobE9Q414 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
ApobE9Q414 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
ApobE9Q414 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
ApobE9Q414 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
ApobE9Q414 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
ApobE9Q414 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
ApobE9Q414 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
ApobE9Q414 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
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