Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0Q3

2610021A01Rik, RIKEN cDNA 2610021A01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610021A01RikE9Q0Q3 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
2610021A01RikE9Q0Q3 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
2610021A01RikE9Q0Q3 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
2610021A01RikE9Q0Q3 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
2610021A01RikE9Q0Q3 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
2610021A01RikE9Q0Q3 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
2610021A01RikE9Q0Q3 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
2610021A01RikE9Q0Q3 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
2610021A01RikE9Q0Q3 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
2610021A01RikE9Q0Q3 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
2610021A01RikE9Q0Q3 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
2610021A01RikE9Q0Q3 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
2610021A01RikE9Q0Q3 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
2610021A01RikE9Q0Q3 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
2610021A01RikE9Q0Q3 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
2610021A01RikE9Q0Q3 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
2610021A01RikE9Q0Q3 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
2610021A01RikE9Q0Q3 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
2610021A01RikE9Q0Q3 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
2610021A01RikE9Q0Q3 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
2610021A01RikE9Q0Q3 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
2610021A01RikE9Q0Q3 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
2610021A01RikE9Q0Q3 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
2610021A01RikE9Q0Q3 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
2610021A01RikE9Q0Q3 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
2610021A01RikE9Q0Q3 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
2610021A01RikE9Q0Q3 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
2610021A01RikE9Q0Q3 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
2610021A01RikE9Q0Q3 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
2610021A01RikE9Q0Q3 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
2610021A01RikE9Q0Q3 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
2610021A01RikE9Q0Q3 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
2610021A01RikE9Q0Q3 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
2610021A01RikE9Q0Q3 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
2610021A01RikE9Q0Q3 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
2610021A01RikE9Q0Q3 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
2610021A01RikE9Q0Q3 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
2610021A01RikE9Q0Q3 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
2610021A01RikE9Q0Q3 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
2610021A01RikE9Q0Q3 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
2610021A01RikE9Q0Q3 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
2610021A01RikE9Q0Q3 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
2610021A01RikE9Q0Q3 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
2610021A01RikE9Q0Q3 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
2610021A01RikE9Q0Q3 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
2610021A01RikE9Q0Q3 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
2610021A01RikE9Q0Q3 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
2610021A01RikE9Q0Q3 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
2610021A01RikE9Q0Q3 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
2610021A01RikE9Q0Q3 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
2610021A01RikE9Q0Q3 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
2610021A01RikE9Q0Q3 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
2610021A01RikE9Q0Q3 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
2610021A01RikE9Q0Q3 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
2610021A01RikE9Q0Q3 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
2610021A01RikE9Q0Q3 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
2610021A01RikE9Q0Q3 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
2610021A01RikE9Q0Q3 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
2610021A01RikE9Q0Q3 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
2610021A01RikE9Q0Q3 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
2610021A01RikE9Q0Q3 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
2610021A01RikE9Q0Q3 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
2610021A01RikE9Q0Q3 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
2610021A01RikE9Q0Q3 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
2610021A01RikE9Q0Q3 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
2610021A01RikE9Q0Q3 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
2610021A01RikE9Q0Q3 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
2610021A01RikE9Q0Q3 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
2610021A01RikE9Q0Q3 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
2610021A01RikE9Q0Q3 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
2610021A01RikE9Q0Q3 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
2610021A01RikE9Q0Q3 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
2610021A01RikE9Q0Q3 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
2610021A01RikE9Q0Q3 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
2610021A01RikE9Q0Q3 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
2610021A01RikE9Q0Q3 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
2610021A01RikE9Q0Q3 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
2610021A01RikE9Q0Q3 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
2610021A01RikE9Q0Q3 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
2610021A01RikE9Q0Q3 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
2610021A01RikE9Q0Q3 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
2610021A01RikE9Q0Q3 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
2610021A01RikE9Q0Q3 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
2610021A01RikE9Q0Q3 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
2610021A01RikE9Q0Q3 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
2610021A01RikE9Q0Q3 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
2610021A01RikE9Q0Q3 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms