Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ddx60E9PZQ1 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ddx60E9PZQ1 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ddx60E9PZQ1 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ddx60E9PZQ1 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ddx60E9PZQ1 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ddx60E9PZQ1 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ddx60E9PZQ1 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ddx60E9PZQ1 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ddx60E9PZQ1 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ddx60E9PZQ1 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ddx60E9PZQ1 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ddx60E9PZQ1 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ddx60E9PZQ1 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ddx60E9PZQ1 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ddx60E9PZQ1 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ddx60E9PZQ1 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ddx60E9PZQ1 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ddx60E9PZQ1 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ddx60E9PZQ1 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ddx60E9PZQ1 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ddx60E9PZQ1 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ddx60E9PZQ1 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ddx60E9PZQ1 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ddx60E9PZQ1 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ddx60E9PZQ1 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ddx60E9PZQ1 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ddx60E9PZQ1 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ddx60E9PZQ1 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ddx60E9PZQ1 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ddx60E9PZQ1 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ddx60E9PZQ1 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ddx60E9PZQ1 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ddx60E9PZQ1 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ddx60E9PZQ1 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ddx60E9PZQ1 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ddx60E9PZQ1 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ddx60E9PZQ1 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ddx60E9PZQ1 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ddx60E9PZQ1 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ddx60E9PZQ1 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ddx60E9PZQ1 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ddx60E9PZQ1 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ddx60E9PZQ1 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ddx60E9PZQ1 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ddx60E9PZQ1 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ddx60E9PZQ1 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ddx60E9PZQ1 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ddx60E9PZQ1 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ddx60E9PZQ1 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ddx60E9PZQ1 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ddx60E9PZQ1 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ddx60E9PZQ1 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ddx60E9PZQ1 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ddx60E9PZQ1 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ddx60E9PZQ1 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ddx60E9PZQ1 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ddx60E9PZQ1 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ddx60E9PZQ1 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ddx60E9PZQ1 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ddx60E9PZQ1 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ddx60E9PZQ1 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ddx60E9PZQ1 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ddx60E9PZQ1 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ddx60E9PZQ1 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ddx60E9PZQ1 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ddx60E9PZQ1 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ddx60E9PZQ1 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ddx60E9PZQ1 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ddx60E9PZQ1 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ddx60E9PZQ1 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ddx60E9PZQ1 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ddx60E9PZQ1 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ddx60E9PZQ1 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ddx60E9PZQ1 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ddx60E9PZQ1 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ddx60E9PZQ1 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ddx60E9PZQ1 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ddx60E9PZQ1 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ddx60E9PZQ1 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ddx60E9PZQ1 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ddx60E9PZQ1 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ddx60E9PZQ1 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ddx60E9PZQ1 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ddx60E9PZQ1 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ddx60E9PZQ1 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ddx60E9PZQ1 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ddx60E9PZQ1 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ddx60E9PZQ1 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ddx60E9PZQ1 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ddx60E9PZQ1 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ddx60E9PZQ1 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ddx60E9PZQ1 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ddx60E9PZQ1 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ddx60E9PZQ1 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ddx60E9PZQ1 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ddx60E9PZQ1 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ddx60E9PZQ1 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ddx60E9PZQ1 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ddx60E9PZQ1 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms