Protein–RNA interactions for Protein: E9PYQ0

Rsph10b, Radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas), mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph10bE9PYQ0 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms