Protein–RNA interactions for Protein: D3Z235

Gm3543, Predicted gene 3543, mousemouse

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Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3543D3Z235 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm3543D3Z235 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm3543D3Z235 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm3543D3Z235 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm3543D3Z235 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm3543D3Z235 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm3543D3Z235 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm3543D3Z235 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm3543D3Z235 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm3543D3Z235 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm3543D3Z235 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm3543D3Z235 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm3543D3Z235 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm3543D3Z235 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm3543D3Z235 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm3543D3Z235 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm3543D3Z235 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm3543D3Z235 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm3543D3Z235 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm3543D3Z235 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm3543D3Z235 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm3543D3Z235 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm3543D3Z235 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm3543D3Z235 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm3543D3Z235 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm3543D3Z235 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm3543D3Z235 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm3543D3Z235 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm3543D3Z235 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm3543D3Z235 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm3543D3Z235 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm3543D3Z235 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm3543D3Z235 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm3543D3Z235 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm3543D3Z235 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm3543D3Z235 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm3543D3Z235 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm3543D3Z235 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm3543D3Z235 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm3543D3Z235 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm3543D3Z235 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm3543D3Z235 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm3543D3Z235 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm3543D3Z235 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm3543D3Z235 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm3543D3Z235 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm3543D3Z235 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm3543D3Z235 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm3543D3Z235 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm3543D3Z235 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm3543D3Z235 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm3543D3Z235 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm3543D3Z235 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm3543D3Z235 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm3543D3Z235 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm3543D3Z235 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm3543D3Z235 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm3543D3Z235 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm3543D3Z235 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm3543D3Z235 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm3543D3Z235 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm3543D3Z235 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm3543D3Z235 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm3543D3Z235 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm3543D3Z235 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm3543D3Z235 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm3543D3Z235 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm3543D3Z235 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm3543D3Z235 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm3543D3Z235 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm3543D3Z235 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm3543D3Z235 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm3543D3Z235 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm3543D3Z235 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm3543D3Z235 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm3543D3Z235 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm3543D3Z235 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm3543D3Z235 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm3543D3Z235 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm3543D3Z235 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm3543D3Z235 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm3543D3Z235 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm3543D3Z235 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm3543D3Z235 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm3543D3Z235 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm3543D3Z235 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm3543D3Z235 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm3543D3Z235 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm3543D3Z235 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm3543D3Z235 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm3543D3Z235 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3543D3Z235 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3543D3Z235 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3543D3Z235 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3543D3Z235 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3543D3Z235 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3543D3Z235 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3543D3Z235 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3543D3Z235 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3543D3Z235 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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