Protein–RNA interactions for Protein: D3YYZ1

Ldlrad1, Low density lipoprotein receptor class A domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldlrad1D3YYZ1 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ldlrad1D3YYZ1 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ldlrad1D3YYZ1 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ldlrad1D3YYZ1 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ldlrad1D3YYZ1 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ldlrad1D3YYZ1 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ldlrad1D3YYZ1 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ldlrad1D3YYZ1 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ldlrad1D3YYZ1 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ldlrad1D3YYZ1 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ldlrad1D3YYZ1 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ldlrad1D3YYZ1 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ldlrad1D3YYZ1 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ldlrad1D3YYZ1 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ldlrad1D3YYZ1 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ldlrad1D3YYZ1 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ldlrad1D3YYZ1 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ldlrad1D3YYZ1 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ldlrad1D3YYZ1 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ldlrad1D3YYZ1 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ldlrad1D3YYZ1 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ldlrad1D3YYZ1 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ldlrad1D3YYZ1 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ldlrad1D3YYZ1 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ldlrad1D3YYZ1 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ldlrad1D3YYZ1 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ldlrad1D3YYZ1 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ldlrad1D3YYZ1 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ldlrad1D3YYZ1 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ldlrad1D3YYZ1 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ldlrad1D3YYZ1 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ldlrad1D3YYZ1 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ldlrad1D3YYZ1 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ldlrad1D3YYZ1 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ldlrad1D3YYZ1 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ldlrad1D3YYZ1 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ldlrad1D3YYZ1 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ldlrad1D3YYZ1 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ldlrad1D3YYZ1 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ldlrad1D3YYZ1 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ldlrad1D3YYZ1 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ldlrad1D3YYZ1 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ldlrad1D3YYZ1 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ldlrad1D3YYZ1 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ldlrad1D3YYZ1 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ldlrad1D3YYZ1 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ldlrad1D3YYZ1 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ldlrad1D3YYZ1 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ldlrad1D3YYZ1 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ldlrad1D3YYZ1 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ldlrad1D3YYZ1 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ldlrad1D3YYZ1 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ldlrad1D3YYZ1 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ldlrad1D3YYZ1 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ldlrad1D3YYZ1 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ldlrad1D3YYZ1 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ldlrad1D3YYZ1 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ldlrad1D3YYZ1 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ldlrad1D3YYZ1 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ldlrad1D3YYZ1 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ldlrad1D3YYZ1 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ldlrad1D3YYZ1 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ldlrad1D3YYZ1 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ldlrad1D3YYZ1 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ldlrad1D3YYZ1 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ldlrad1D3YYZ1 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ldlrad1D3YYZ1 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ldlrad1D3YYZ1 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ldlrad1D3YYZ1 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ldlrad1D3YYZ1 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ldlrad1D3YYZ1 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ldlrad1D3YYZ1 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ldlrad1D3YYZ1 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ldlrad1D3YYZ1 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ldlrad1D3YYZ1 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ldlrad1D3YYZ1 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ldlrad1D3YYZ1 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ldlrad1D3YYZ1 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ldlrad1D3YYZ1 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ldlrad1D3YYZ1 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ldlrad1D3YYZ1 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ldlrad1D3YYZ1 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ldlrad1D3YYZ1 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ldlrad1D3YYZ1 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ldlrad1D3YYZ1 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ldlrad1D3YYZ1 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ldlrad1D3YYZ1 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ldlrad1D3YYZ1 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ldlrad1D3YYZ1 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ldlrad1D3YYZ1 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ldlrad1D3YYZ1 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ldlrad1D3YYZ1 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ldlrad1D3YYZ1 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ldlrad1D3YYZ1 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ldlrad1D3YYZ1 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ldlrad1D3YYZ1 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ldlrad1D3YYZ1 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ldlrad1D3YYZ1 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ldlrad1D3YYZ1 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ldlrad1D3YYZ1 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms