Protein–RNA interactions for Protein: D3YUK0

Gm3259, Predicted gene 3259, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3259D3YUK0 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3259D3YUK0 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3259D3YUK0 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3259D3YUK0 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3259D3YUK0 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3259D3YUK0 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3259D3YUK0 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3259D3YUK0 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3259D3YUK0 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3259D3YUK0 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3259D3YUK0 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3259D3YUK0 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3259D3YUK0 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3259D3YUK0 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3259D3YUK0 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3259D3YUK0 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3259D3YUK0 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3259D3YUK0 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3259D3YUK0 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3259D3YUK0 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3259D3YUK0 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3259D3YUK0 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3259D3YUK0 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3259D3YUK0 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3259D3YUK0 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3259D3YUK0 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3259D3YUK0 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3259D3YUK0 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3259D3YUK0 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3259D3YUK0 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3259D3YUK0 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3259D3YUK0 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3259D3YUK0 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3259D3YUK0 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3259D3YUK0 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3259D3YUK0 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3259D3YUK0 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3259D3YUK0 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3259D3YUK0 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3259D3YUK0 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3259D3YUK0 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3259D3YUK0 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3259D3YUK0 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3259D3YUK0 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3259D3YUK0 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3259D3YUK0 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3259D3YUK0 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3259D3YUK0 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3259D3YUK0 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3259D3YUK0 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3259D3YUK0 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3259D3YUK0 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3259D3YUK0 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3259D3YUK0 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3259D3YUK0 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3259D3YUK0 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3259D3YUK0 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3259D3YUK0 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3259D3YUK0 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3259D3YUK0 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3259D3YUK0 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3259D3YUK0 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3259D3YUK0 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3259D3YUK0 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3259D3YUK0 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3259D3YUK0 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3259D3YUK0 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3259D3YUK0 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3259D3YUK0 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3259D3YUK0 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3259D3YUK0 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3259D3YUK0 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3259D3YUK0 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3259D3YUK0 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3259D3YUK0 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3259D3YUK0 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3259D3YUK0 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3259D3YUK0 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3259D3YUK0 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3259D3YUK0 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3259D3YUK0 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3259D3YUK0 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3259D3YUK0 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3259D3YUK0 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3259D3YUK0 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3259D3YUK0 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3259D3YUK0 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3259D3YUK0 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3259D3YUK0 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3259D3YUK0 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3259D3YUK0 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3259D3YUK0 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3259D3YUK0 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3259D3YUK0 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3259D3YUK0 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3259D3YUK0 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3259D3YUK0 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3259D3YUK0 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3259D3YUK0 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3259D3YUK0 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms