Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms