Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Clrn2B2RVW2 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Clrn2B2RVW2 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Clrn2B2RVW2 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Clrn2B2RVW2 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Clrn2B2RVW2 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Clrn2B2RVW2 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms