Protein–RNA interactions for Protein: B1AUF7

1700042G07Rik, MCG1049117, mousemouse

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Length 90 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700042G07RikB1AUF7 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.28□□□□□ -1.08
1700042G07RikB1AUF7 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC8.28□□□□□ -1.08
1700042G07RikB1AUF7 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
1700042G07RikB1AUF7 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
1700042G07RikB1AUF7 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.28□□□□□ -1.08
1700042G07RikB1AUF7 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC8.28□□□□□ -1.08
1700042G07RikB1AUF7 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
1700042G07RikB1AUF7 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
1700042G07RikB1AUF7 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
1700042G07RikB1AUF7 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
1700042G07RikB1AUF7 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
1700042G07RikB1AUF7 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
1700042G07RikB1AUF7 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
1700042G07RikB1AUF7 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
1700042G07RikB1AUF7 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
1700042G07RikB1AUF7 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
1700042G07RikB1AUF7 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
1700042G07RikB1AUF7 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
1700042G07RikB1AUF7 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
1700042G07RikB1AUF7 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.28□□□□□ -1.08
1700042G07RikB1AUF7 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
1700042G07RikB1AUF7 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
1700042G07RikB1AUF7 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
1700042G07RikB1AUF7 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
1700042G07RikB1AUF7 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
1700042G07RikB1AUF7 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
1700042G07RikB1AUF7 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
1700042G07RikB1AUF7 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
1700042G07RikB1AUF7 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
1700042G07RikB1AUF7 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
1700042G07RikB1AUF7 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
1700042G07RikB1AUF7 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
1700042G07RikB1AUF7 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
1700042G07RikB1AUF7 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
1700042G07RikB1AUF7 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
1700042G07RikB1AUF7 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
1700042G07RikB1AUF7 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
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1700042G07RikB1AUF7 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
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1700042G07RikB1AUF7 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
1700042G07RikB1AUF7 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
1700042G07RikB1AUF7 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.08
1700042G07RikB1AUF7 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.08
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1700042G07RikB1AUF7 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.08
1700042G07RikB1AUF7 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.08
1700042G07RikB1AUF7 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.08
1700042G07RikB1AUF7 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.08
1700042G07RikB1AUF7 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.08
1700042G07RikB1AUF7 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.08
1700042G07RikB1AUF7 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.08
1700042G07RikB1AUF7 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
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1700042G07RikB1AUF7 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
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1700042G07RikB1AUF7 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
1700042G07RikB1AUF7 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
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1700042G07RikB1AUF7 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
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1700042G07RikB1AUF7 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC8.27□□□□□ -1.09
1700042G07RikB1AUF7 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC8.27□□□□□ -1.09
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1700042G07RikB1AUF7 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
1700042G07RikB1AUF7 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
1700042G07RikB1AUF7 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
1700042G07RikB1AUF7 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
1700042G07RikB1AUF7 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
1700042G07RikB1AUF7 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
1700042G07RikB1AUF7 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
1700042G07RikB1AUF7 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
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1700042G07RikB1AUF7 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
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1700042G07RikB1AUF7 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
1700042G07RikB1AUF7 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
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1700042G07RikB1AUF7 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.27□□□□□ -1.09
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1700042G07RikB1AUF7 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
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