Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms