Protein–RNA interactions for Protein: B1ARV6

Pramef20, PRAME family member 20, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef20B1ARV6 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Pramef20B1ARV6 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Pramef20B1ARV6 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Pramef20B1ARV6 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Pramef20B1ARV6 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Pramef20B1ARV6 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Pramef20B1ARV6 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
Pramef20B1ARV6 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Pramef20B1ARV6 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pramef20B1ARV6 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pramef20B1ARV6 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pramef20B1ARV6 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pramef20B1ARV6 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pramef20B1ARV6 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pramef20B1ARV6 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pramef20B1ARV6 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
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