Protein–RNA interactions for Protein: A3KG49

Gm5640, Predicted gene 5640, mousemouse

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Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5640A3KG49 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5640A3KG49 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5640A3KG49 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5640A3KG49 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5640A3KG49 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5640A3KG49 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5640A3KG49 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5640A3KG49 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5640A3KG49 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5640A3KG49 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5640A3KG49 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5640A3KG49 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5640A3KG49 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5640A3KG49 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5640A3KG49 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5640A3KG49 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5640A3KG49 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5640A3KG49 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5640A3KG49 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5640A3KG49 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5640A3KG49 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5640A3KG49 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5640A3KG49 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm5640A3KG49 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm5640A3KG49 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm5640A3KG49 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Gm5640A3KG49 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm5640A3KG49 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm5640A3KG49 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm5640A3KG49 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm5640A3KG49 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm5640A3KG49 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm5640A3KG49 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm5640A3KG49 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm5640A3KG49 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Gm5640A3KG49 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm5640A3KG49 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm5640A3KG49 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Gm5640A3KG49 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm5640A3KG49 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm5640A3KG49 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm5640A3KG49 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm5640A3KG49 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm5640A3KG49 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm5640A3KG49 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Gm5640A3KG49 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Gm5640A3KG49 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm5640A3KG49 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm5640A3KG49 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm5640A3KG49 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm5640A3KG49 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm5640A3KG49 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm5640A3KG49 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm5640A3KG49 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm5640A3KG49 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm5640A3KG49 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm5640A3KG49 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm5640A3KG49 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm5640A3KG49 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm5640A3KG49 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm5640A3KG49 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm5640A3KG49 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm5640A3KG49 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm5640A3KG49 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm5640A3KG49 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm5640A3KG49 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm5640A3KG49 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm5640A3KG49 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm5640A3KG49 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm5640A3KG49 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm5640A3KG49 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm5640A3KG49 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm5640A3KG49 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm5640A3KG49 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm5640A3KG49 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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