Protein–RNA interactions for Protein: A2AGT5

Ckap5, Cytoskeleton-associated protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap5A2AGT5 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ckap5A2AGT5 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ckap5A2AGT5 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ckap5A2AGT5 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ckap5A2AGT5 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ckap5A2AGT5 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ckap5A2AGT5 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ckap5A2AGT5 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ckap5A2AGT5 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ckap5A2AGT5 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ckap5A2AGT5 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ckap5A2AGT5 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ckap5A2AGT5 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ckap5A2AGT5 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ckap5A2AGT5 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ckap5A2AGT5 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ckap5A2AGT5 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ckap5A2AGT5 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ckap5A2AGT5 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ckap5A2AGT5 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ckap5A2AGT5 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ckap5A2AGT5 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ckap5A2AGT5 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ckap5A2AGT5 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ckap5A2AGT5 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ckap5A2AGT5 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ckap5A2AGT5 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ckap5A2AGT5 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ckap5A2AGT5 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ckap5A2AGT5 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ckap5A2AGT5 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ckap5A2AGT5 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ckap5A2AGT5 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ckap5A2AGT5 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ckap5A2AGT5 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ckap5A2AGT5 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ckap5A2AGT5 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ckap5A2AGT5 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ckap5A2AGT5 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ckap5A2AGT5 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ckap5A2AGT5 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ckap5A2AGT5 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ckap5A2AGT5 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ckap5A2AGT5 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ckap5A2AGT5 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ckap5A2AGT5 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ckap5A2AGT5 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ckap5A2AGT5 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ckap5A2AGT5 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ckap5A2AGT5 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ckap5A2AGT5 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ckap5A2AGT5 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ckap5A2AGT5 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ckap5A2AGT5 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ckap5A2AGT5 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ckap5A2AGT5 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ckap5A2AGT5 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ckap5A2AGT5 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ckap5A2AGT5 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ckap5A2AGT5 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ckap5A2AGT5 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ckap5A2AGT5 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ckap5A2AGT5 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ckap5A2AGT5 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ckap5A2AGT5 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ckap5A2AGT5 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ckap5A2AGT5 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ckap5A2AGT5 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ckap5A2AGT5 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ckap5A2AGT5 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ckap5A2AGT5 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ckap5A2AGT5 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ckap5A2AGT5 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ckap5A2AGT5 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ckap5A2AGT5 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ckap5A2AGT5 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ckap5A2AGT5 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ckap5A2AGT5 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ckap5A2AGT5 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ckap5A2AGT5 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ckap5A2AGT5 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ckap5A2AGT5 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ckap5A2AGT5 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ckap5A2AGT5 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ckap5A2AGT5 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ckap5A2AGT5 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ckap5A2AGT5 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ckap5A2AGT5 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ckap5A2AGT5 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ckap5A2AGT5 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ckap5A2AGT5 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ckap5A2AGT5 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ckap5A2AGT5 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ckap5A2AGT5 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ckap5A2AGT5 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ckap5A2AGT5 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ckap5A2AGT5 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ckap5A2AGT5 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ckap5A2AGT5 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ckap5A2AGT5 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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