Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms