Protein–RNA interactions for Protein: A2A6M5

Calcoco2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calcoco2A2A6M5 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Calcoco2A2A6M5 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Calcoco2A2A6M5 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Calcoco2A2A6M5 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Calcoco2A2A6M5 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Calcoco2A2A6M5 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Calcoco2A2A6M5 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Calcoco2A2A6M5 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Calcoco2A2A6M5 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Calcoco2A2A6M5 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Calcoco2A2A6M5 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Calcoco2A2A6M5 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Calcoco2A2A6M5 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Calcoco2A2A6M5 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Calcoco2A2A6M5 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Calcoco2A2A6M5 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Calcoco2A2A6M5 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Calcoco2A2A6M5 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Calcoco2A2A6M5 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Calcoco2A2A6M5 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Calcoco2A2A6M5 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Calcoco2A2A6M5 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Calcoco2A2A6M5 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Calcoco2A2A6M5 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Calcoco2A2A6M5 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Calcoco2A2A6M5 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Calcoco2A2A6M5 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Calcoco2A2A6M5 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Calcoco2A2A6M5 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Calcoco2A2A6M5 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Calcoco2A2A6M5 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Calcoco2A2A6M5 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Calcoco2A2A6M5 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Calcoco2A2A6M5 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Calcoco2A2A6M5 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Calcoco2A2A6M5 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Calcoco2A2A6M5 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Calcoco2A2A6M5 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Calcoco2A2A6M5 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Calcoco2A2A6M5 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Calcoco2A2A6M5 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Calcoco2A2A6M5 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Calcoco2A2A6M5 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Calcoco2A2A6M5 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Calcoco2A2A6M5 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Calcoco2A2A6M5 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Calcoco2A2A6M5 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Calcoco2A2A6M5 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Calcoco2A2A6M5 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Calcoco2A2A6M5 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Calcoco2A2A6M5 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Calcoco2A2A6M5 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Calcoco2A2A6M5 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Calcoco2A2A6M5 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Calcoco2A2A6M5 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Calcoco2A2A6M5 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Calcoco2A2A6M5 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Calcoco2A2A6M5 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Calcoco2A2A6M5 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Calcoco2A2A6M5 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Calcoco2A2A6M5 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Calcoco2A2A6M5 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Calcoco2A2A6M5 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Calcoco2A2A6M5 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Calcoco2A2A6M5 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Calcoco2A2A6M5 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Calcoco2A2A6M5 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Calcoco2A2A6M5 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Calcoco2A2A6M5 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Calcoco2A2A6M5 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Calcoco2A2A6M5 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Calcoco2A2A6M5 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Calcoco2A2A6M5 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Calcoco2A2A6M5 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Calcoco2A2A6M5 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Calcoco2A2A6M5 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Calcoco2A2A6M5 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Calcoco2A2A6M5 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Calcoco2A2A6M5 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Calcoco2A2A6M5 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Calcoco2A2A6M5 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Calcoco2A2A6M5 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Calcoco2A2A6M5 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Calcoco2A2A6M5 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Calcoco2A2A6M5 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Calcoco2A2A6M5 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Calcoco2A2A6M5 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Calcoco2A2A6M5 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Calcoco2A2A6M5 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Calcoco2A2A6M5 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Calcoco2A2A6M5 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Calcoco2A2A6M5 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Calcoco2A2A6M5 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Calcoco2A2A6M5 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Calcoco2A2A6M5 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Calcoco2A2A6M5 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Calcoco2A2A6M5 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Calcoco2A2A6M5 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Calcoco2A2A6M5 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Calcoco2A2A6M5 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.1 ms