Protein–RNA interactions for Protein: A0N8N6

Trav12-2, T cell receptor alpha variable 12-2 (Fragment), mousemouse

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav12-2A0N8N6 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Trav12-2A0N8N6 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Trav12-2A0N8N6 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trav12-2A0N8N6 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trav12-2A0N8N6 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trav12-2A0N8N6 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trav12-2A0N8N6 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trav12-2A0N8N6 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trav12-2A0N8N6 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trav12-2A0N8N6 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trav12-2A0N8N6 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trav12-2A0N8N6 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trav12-2A0N8N6 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trav12-2A0N8N6 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trav12-2A0N8N6 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trav12-2A0N8N6 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trav12-2A0N8N6 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trav12-2A0N8N6 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trav12-2A0N8N6 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trav12-2A0N8N6 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trav12-2A0N8N6 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trav12-2A0N8N6 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trav12-2A0N8N6 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trav12-2A0N8N6 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trav12-2A0N8N6 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trav12-2A0N8N6 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trav12-2A0N8N6 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trav12-2A0N8N6 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trav12-2A0N8N6 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trav12-2A0N8N6 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trav12-2A0N8N6 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trav12-2A0N8N6 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trav12-2A0N8N6 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trav12-2A0N8N6 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trav12-2A0N8N6 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trav12-2A0N8N6 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trav12-2A0N8N6 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trav12-2A0N8N6 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Trav12-2A0N8N6 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trav12-2A0N8N6 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trav12-2A0N8N6 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trav12-2A0N8N6 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trav12-2A0N8N6 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trav12-2A0N8N6 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trav12-2A0N8N6 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
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Trav12-2A0N8N6 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trav12-2A0N8N6 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trav12-2A0N8N6 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trav12-2A0N8N6 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trav12-2A0N8N6 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trav12-2A0N8N6 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trav12-2A0N8N6 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trav12-2A0N8N6 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trav12-2A0N8N6 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Trav12-2A0N8N6 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Trav12-2A0N8N6 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trav12-2A0N8N6 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trav12-2A0N8N6 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trav12-2A0N8N6 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trav12-2A0N8N6 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trav12-2A0N8N6 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trav12-2A0N8N6 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Trav12-2A0N8N6 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trav12-2A0N8N6 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trav12-2A0N8N6 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trav12-2A0N8N6 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trav12-2A0N8N6 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trav12-2A0N8N6 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trav12-2A0N8N6 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trav12-2A0N8N6 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trav12-2A0N8N6 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trav12-2A0N8N6 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trav12-2A0N8N6 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trav12-2A0N8N6 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trav12-2A0N8N6 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trav12-2A0N8N6 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trav12-2A0N8N6 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trav12-2A0N8N6 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trav12-2A0N8N6 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Trav12-2A0N8N6 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trav12-2A0N8N6 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trav12-2A0N8N6 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trav12-2A0N8N6 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trav12-2A0N8N6 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trav12-2A0N8N6 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Trav12-2A0N8N6 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trav12-2A0N8N6 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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