Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Top3bQ9Z321 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms