Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2S7

Tsc22d3, TSC22 domain family protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsc22d3Q9Z2S7 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tsc22d3Q9Z2S7 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tsc22d3Q9Z2S7 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tsc22d3Q9Z2S7 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tsc22d3Q9Z2S7 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tsc22d3Q9Z2S7 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tsc22d3Q9Z2S7 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tsc22d3Q9Z2S7 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tsc22d3Q9Z2S7 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tsc22d3Q9Z2S7 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tsc22d3Q9Z2S7 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms